請求書ごとに税区分(内税、外税)の設定は可能ですか?

【設定|自社情報】画面で設定した税区分(内税、外勢)は、各帳票画面で変更することができます。

各帳票画面の品目にある「課税設定」ボタンをクリックしていただくと、課税設定のポップアップが表示されます。

課税設定では「消費税」「消費税端数処理」「源泉徴収」の設定が変更できます。